日本早稻田大学专业设有：
学术院
政治经济学术院
政治经济学部
政治学科
经济学科
国际政治经济学科
政治学研究科
经济学研究科
公共经营大学院
法学学术院
法学部
法学研究科
法务研究科（法科大学院（Law School））
文学学术院
以早稻田大学原‘第一文学部’、‘第二文学部’为主体，于2007年整合、重组为‘文化构想学部’与‘文学部’。
文化构想学部
文化构想学科
文学部
文学科
文学研究科
教育・总合科学学术院
教育学部
教育学科
国语国文学科
英语英文学科
社会科
理学科
数学科（原本的理学科数学专修，2007年新设）
复合文化学科（原本的学际课程，2007年新设）
教育学研究科
商学学术院
商学部
商学研究科
商学专攻
企业专攻（Waseda Business School，于2007年开设，为原本的亚洲太平洋研究科国际经营学专攻）
财务金融研究科
会计研究科
理工学术院
以早稻田大学原“理工学部”、大学院“理工学研究科”为主体，于2007年改组为理工系三学部、大学院三研究科为中心的‘总合理工系’教育・研究机关。
基干理工学部
数学科
应用数理学科
情报理工学科
机械科学・航空学科
电子光系统学科
表现工学科
创造理工学部
建筑学科
总合机械工学科
经营系统工学科
社会环境工学科
环境资源工学科
知财・产业社会政策领域
国际文化领域
先进理工学部
物理学科
应用物理学科
化学·生命化学科
应用化学科
生命医科学科
电气・情报生命工学科
基干理工学研究科
先进理工学研究科
创造理工学研究科
情报生产系统研究科
环境能源研究科
社会科学总合学术院
社会科学部
社会科学研究科
人类科学学术院
人类科学部
人类环境科学科
健康福祉科学科
人类情报科学科
通信教育课程
人类科学研究科
体育科学学术院
体育科学部
体育文化学科
体育医科学科
体育经济与管理学科
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